Der MHWK kooperiert mit verschiedensten Einrichtungen und Organisationen in Wirtschaft, Wissenschaft, Politik, Verwaltung und Gesellschaft. Ausgewählte Partner mit aktuellen Kooperationsvereinbarungen sind:
ABU – Akademie für Berufsförderung und Umschulung gGmbH
Alice Salomon Hochschule (ASH)
Heimatverein Marzahn-Hellersdorf
Marzahn-Hellersdorfer Städtepartnerschaftsverein e.V.
Stiftung OST-WEST-BEGEGNUNGSSTÄTTE Schloss Biesdorf e.V.